08/03/08

4.4 Interroger PUBMED-MEDLINE

Rechercher un article sur PUBMED-MEDLINE avec des mots-clés

La base de données bibliographiques PUBMED-MEDLINE (lien) est produite principalement par la NLM (National Library of Medicine) aux Etats-Unis. Elle contient les notices bibliographiques des articles d’une grande partie des périodiques en collection à la bibliothèque des écoles hospitalières. Elle bénéficie depuis fin 2009 d'une nouvelle interface de recherche. Pour l’interroger en français, la démarche la plus simple consiste dans un premier temps à utiliser le thésaurus MESH pour vérifier l’exactitude des termes à employer et obtenir la traduction précise des termes en anglais.

Vous pouvez consulter la présentation complète de PUBMED en pdf provenant du SCD de l'Université Paris 5 - René Descartes (lien).

Procédure pas à pas pour interroger le MESH

Rendez vous sur le MESH (Medical Subject Heading) bilingue français - anglais (MESH blingue)
Coproduit par la NLM et l’INSERM, ce répertoire terminologique vous permet de vérifier en français si les mots-clés choisis pour votre recherche correspondent à ceux utilisés sur PUBMED (mais aussi sur le CISMEF).

Sur la page d’accueil du MESH, cliquez sur la recherche guidée par les index : http://mesh.inserm.fr/mesh/search/index.jsp , ou par l'arborescence : http://mesh.inserm.fr/mesh/view/index.jsp

Une fois sur la page de la recherche simple , inscrivez dans le champ "termes en français" le terme à soumettre.

L’astérisque (*) fait office de troncature après votre terme.

Par exemple (soi*) donne 242 mots-clés contenant les 3 lettres (soi) comme :affirmation de soi ; service soi-ns cancérologie ; soi-ns de jour ; mais aussi ego (synonyme français de soi) etc.

CONSEIL : Utilisez toujours les troncatures (*) à droite pour étendre votre recherche. Par exemple (soin) sans troncature donne 5 résultats seulement, alors que (soin*) donne 194 résultats plus précis.

Une liste de termes s’affiche. Une fois un terme pertinent sélectionné, vous pouvez reprendre sa traduction (Descripteur anglais) et obtenir la notice terminologique complète du terme qui comporte le plus souvent la définition en usage du descripteur (c'est à dire du mot-clé à utiliser sur PUBMED) et ses synonymes. Cela vous permet de confronter cette définition à vos propres besoins.

ATTENTION : l'interface d'interrogation de Pubmed ayant récemment évoluée, la suite de la procédure et la syntaxe en usage n'est plus appropriée. Elle sera prochainement mise à jour. En attendant, vous pouvez utiliser la présentation mise en ligne par le Service Commun de Documentation de l'Université Paris 5, proposée en début de section.

Rendez-vous ensuite sur PUBMED-MEDLINE et inscrivez votre descripteur en américain dans le champs -Search: Pubmed-, en n'oubliant pas les guillemets avant et après le terme ainsi que les lettres [MH] entre crochets immédiatement accolées au terme. Ce signalement indique que le descripteur employé provient du thésaurus MESH.

Attention, si vous utilisez des opérateurs logiques (opérateurs booléens) pour combiner les mots-clés, inscrivez les opérateurs AND, OR, NOT (pour et, ou, sauf).
Par exemple ("epistaxis"[MH] AND "nursing care"[MH]), vous donnera des résultats pour "epistaxis" et "soins infirmiers".
Si vous souhaitez obtenir des résultats issus de documents en français, cliquez sur le lien -Advanced search- et cochez dans la section -Languages- la langue française (French), puis lancez la requête avec le bouton - Search-.

Autre possibilité : inscrivez directement dans le champs -Search- en plus de la requête d'origine les éléments suivant : AND French[lang]
Ce qui donne pour notre exemple :
"epistaxis"[MH] AND "nursing care"[MH] AND French[lang]
Les résultats se présentent ici comme dans les autres bases sous forme de liste de notices abrégées. Pour accéder à la notice complète, cliquez sur le lien proposé.
En haut et à droite des résultats vous pouvez rapidement repérer dans le pavé (Filter your results) si des articles sont directement disponibles en ligne (Free Full Texte).
Les titres des périodiques sont également indiqués sous la forme abrégée, mais restent aisément reconnaissables.Par exemple :
« Rev Prat. » pour La revue du praticien
« J Gynecol Obstet Biol Reprod » pour Journal de gynécologie obstétrique et biologie de la reproduction
« Soins Gerontol. » pour Soins Gérontologie etc.
CONSEIL : Sur la notice détaillée, si vous déplacez la souris sur le titre abrégé de la revue, le titre complet apparaît dans une étiquette. Autre possibilité, en faisant un clic gauche sur le titre de la revue, une fenêtre (Links) apparaît. Choisissez –Journals- et la notice bibliographique de la revue s’affiche avec le titre complet et l’ISSN du périodique.

Attention, cette base de données bibliographique est en anglais. Même si les périodiques indexés que vous recherchez sont francophones, les notices demeurent en anglais.

Il vous reste à comparer les notices intéressantes avec la liste des périodiques en abonnements à la bibliothèque (voir sur ce site la section 1.4 comportant la liste des périodiques en abonnement). Si le périodique est reçu à la bibliothèque, vous pourrez le consulter sur place (attention, avant 1990 les périodiques sont archivés).
Si le périodique n’est pas reçu à la bibliothèque, vous pouvez interroger le catalogue du SUDOC (lien) en reprenant le titre exacte du périodique ou son ISSN, et localiser les Bibliothèques Universitaires de Médecine (dont celle de Nancy) et les Bibliothèques Universitaire (dont celle de Metz) où le périodique demandé est en collection (indication de la localisation du document en haut de la page de la notice complète du périodique issue du SUDOC avec le bouton localisation).
Une fois vérifiée la disponibilité du périodique sous forme de reproduction (photocopies) pour le prêt entre bibliothèques (PEB), rendez-vous à la BU de Metz et demandez au bureau du prêt à obtenir le document, après votre inscription comme lecteur auprès de l’établissement (inscription gratuite par convention pour les étudiants des écoles hospitalières de Metz) et l'ouverture d'un compte au bureau du PEB. Les tarifs des photocopies souhaitées, vous seront indiqués. Après votre inscription et l'ouverture de votre compte, vous pourrez également remplir le formulaire de demande de PEB en ligne partir du portail du SCD de Metz (lien).
Pour suivre la démarche d’interrogation du SUDOC, rendez-vous à la section 4.6.

Un exemple de recherche sur PUBMED-MEDLINE

Je recherche des informations sur les hémorragies.

Sur la recherche du MESH, j'inscris la requête saign* pour obtenir des termes avec saignement ou hémorragie. Dans la liste des résultats, je choisis «hémorragie» synonyme ici de saignement, son équivalent américain s’écrit «Hemorrhage».

Sur PUBMED, j'inscris le terme dans le champs -Search- : "Hemorrhage" [MH]. Je choisis la langue française (avec Advanced search, ou Limits pour filtrer les résultats) et je lance la recherche.

Une liste de résultats pour des périodiques francophones s'affiche.

J'affiche les notices complètes intéressantes, je compare avec la liste des revues en abonnement à la bibliothèque, et je télécharge les documents en accès libre (Free Full Text). Si la revue n’est pas en abonnement à la bibliothèque des écoles hospitalières, je repère la revue sur le SUDOC et j'en demande une copie au service du PEB.